同種移植片の拒絶は、ドナー組織によって発現された非自己抗原に対するレシピエントの同種免疫反応の結果です。臓器同種移植片の移植後、抗原提示には 2 つの経路が存在します。直接経路では、レシピエント T 細胞はドナー細胞の表面に発現した無傷の同種異系 MHC 分子に反応します。この経路は宿主の CD4 または CD8 T 細胞を活性化します。対照的に、移植片から脱落したドナー MHC 分子 (および他のすべてのタンパク質) は、宿主 APC によって取り込まれ、自己 MHC 分子の状況 (間接経路) でレシピエント T 細胞に提示されます。このような提示は主に CD4 T 細胞を活性化します。移植片細胞に対する直接的な細胞傷害性 T 細胞攻撃は、移植片 MHC 分子を直接認識する T 細胞によってのみ行うことができます。それにもかかわらず、間接的な同種特異性を持つ T 細胞は、組織損傷や線維化を引き起こすマクロファージを活性化することで移植片拒絶に寄与する可能性があり、移植片に対する同種抗体反応の発現にも重要である可能性があります。